Я поднял предмет коллекции, но он не появился в списке.

Если этот предмет плавно пропал над вами после взятия - это "мираж" коллекции, который не является настоящим предметом коллекции.
Есле же вы подняли предмет, но не дошли до дупла (успешно закончили игру) - он так же не будет начислен.